A gestão do Criatec é realizada por um consórcio formado pela Antera Gestão de Recursos S.A. e a Inseed Investimentos Ltda, do Grupo Instituto Inovação. O consórcio foi selecionado por edital do BNDES em 2007.

Para a operação do Fundo, Antera e Inseed contrataram 7 Consultoras Regionais, que executam in loco todo o trabalho de prospecção, acompanhamento e desinvestimento.

O órgão máximo deliberativo do Fundo Criatec, abaixo da Assembleia Geral de Quotistas, é o Comitê de Investimentos, composto por representantes dos cotistas, do consórcio gestor e conselheiros externos.